Skenējošā elektronu mikroskopa galvenās sastāvdaļas ir:
Elektronu avots — šeit tiek termiski ģenerēti elektroni pie sprieguma 1-40kV. Elektroni kondensējas saišķos, ko izmanto, lai izveidotu simulētus attēlus un analīzi. Var izmantot trīs veidu elektronu avotus. e volframa stieple, lantāna heksaborīds un lauka emisijas lielgabals (FEG)
Lēcas - Tam ir vairākas kondensatora lēcas, kas fokusē elektronu staru no avota caur kolonnu šaurā starā, veidojot plankumu, ko sauc par vietas izmēru.
Skenēšanas spole – izmanto, lai novirzītu staru uz parauga virsmu.
Detektors – sastāv no vairākiem detektoriem, kas spēj atšķirt sekundāros elektronus, atpakaļizkliedētos elektronus un difraktos atpakaļizkliedētos elektronus. Detektora funkcionalitāte lielā mērā ir atkarīga no sprieguma ātruma, parauga blīvuma.
Displeja ierīce (datu izvades ierīce)
enerģijas padeve
Vakuuma sistēma
Tāpat kā transmisijas elektronu mikroskopam, skenējošajam elektronu mikroskopam nevajadzētu būt vibrācijām un jebkādiem elektromagnētiskiem elementiem.
