Elektronu mikroskopijaizmanto signālus, kas rodas, mijiedarbojoties elektronu staram ar paraugu, lai iegūtu informāciju par struktūru, morfoloģiju un sastāvu.
Elektronu lielgabali ražo elektronus.
Divi kondensatoru komplekti fokusē elektronu staru uz paraugu, kur tas tiek fokusēts plānā starā.
Lai pārvietotu elektronus lejup pa kolonnu, starp volframa pavedienu un anodu tiek pielikts paātrinājuma spriegums (parasti starp 100 kV-1000 kV).
Pārbaudāmie paraugi ir ļoti plāni, vismaz 200 reizes plānāki par gaismas mikroskopu. Izgrieziet īpaši plānas 20-100 nm daļas, kas ir novietotas uz parauga turētāja.
Elektronu stars iet cauri paraugam, un elektroni tiek izkliedēti atkarībā no dažādu parauga daļu biezuma vai laušanas koeficienta.
Blīvie laukumi paraugā izkliedē vairāk elektronu un tāpēc attēlā šķiet tumšāki, jo mazāk elektronu skar šo ekrāna apgabalu. Un otrādi, caurspīdīgās zonas ir gaišākas.
Elektronu stars, kas izplūst no parauga, sasniedz objektīvu, kam ir liela jauda un kas veido starpposma palielinātu attēlu.
Pēc tam okulārs rada galīgo, vēl vairāk palielinātu attēlu.
